吡咯并喹啉醌二钠盐是一种常用的抗疟药物，但是在使用时也有一些副作用需要注意。

首先，吡咯并喹啉醌二钠盐可能会引起胃肠道不适，如恶心、呕吐、腹泻等症状。这是因为该药物会对胃肠道黏膜产生刺激作用。

其次，长期或大剂量使用吡咯并喹啉醌二钠盐还可能导致眼部问题，如视力模糊、色觉异常等。这是因为该药物会对视网膜产生一定的损伤作用。

此外，吡咯并喹啉醌二钠盐还可能引起皮肤过敏反应，如皮疹、瘙痒等症状。对于已经有过敏史的患者，应该特别注意使用该药物。

最后，吡咯并喹啉醌二钠盐还可能对血液系统产生一定的影响，如贫血、血小板减少等。因此，在使用该药物时需要进行定期的血液检查。

总的来说，吡咯并喹啉醌二钠盐是一种有效的抗疟药物，但是在使用时需要注意以上副作用，并在医生的指导下合理使用。